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微生物群落多样性分析全新升级!
2018-03-18 15:11

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微生物群落多样性分析是指利用新一代高通量测序技术,对微生物的16S rDNA、18S rDNA高变区域以及ITS区,或者功能基因进行测序,分析环境中细菌、古细菌以及真菌的种类组成和丰度,揭示环境样品中微生物种类以及它们之间的相对丰度和进化关系,进一步探讨微生物群落多样性;对于研究微生物与人类医疗健康、食品安全、环境检测与治理、微生物资源的利用等有着非常重要的理论和现实意义。


      安诺基因现对微生物群落多样性分析进行全新升级,小伙伴们快来尝鲜吧!


1. 全新的测序平台,测序更长更准确

       MiSeq PE250/PE300和HiSeq2500 PE250两种平台可供选择,给您更快更高的测序体验;


2. 分析内容更全面,数据挖掘更深入

       增加物种优势指数分析、LefSe分析,增加PCA和PCoA分析,增加组间显著性差异分析,增加Co-abundance network analysis;


3. 结果展示更清晰,查阅读取更便利

       结果展示多种形式、美观,可直接用于文章的发表;新版结题报告更新,有效提升阅读体验。


结果展示


 物种统计柱状图.png

图1. 物种统计柱状图

从门、纲、目、科、属不同层次进行物种种类和丰度统计,纵坐标表示每个样本中的物种含量,横坐标分别表示样本。


 

物种丰度聚类.png

图2. 物种丰度聚类

横向为样品信息,纵向为物种注释信息;图中左侧的聚类树为物种聚类树,上方的聚类树为样品聚类树,中间热图对应的值为每一行物种相对丰度经过标准化处理后得到的Z值。


 

物种进化树分析.png

图3. 物种进化树分析

  三种颜色分别代表在整棵树里面比较重要的一些子树,包含序列越多圆圈越大


物种进化树分析.png

 

图4. LefSe分析

横坐标表示每个物种的LDA得分,每个柱子表示一个物种。


 

PCA分析.png

PCoA分析.png


图5. PCA和PCoA分析


 

Co-abundance network analysis.png

图6. Co-abundance network analysis

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